Mirco MIcroRna in Clinica Oncologica
DATA INZIO 1 aprile 2014
DATA FINE 31 dicembre 2015
I principali obiettivi di questo progetto consistono nello sviluppo di un approccio metodologico integrato che consenta di valutare l’espressione di miRNA selezionati e di combinare i risultati ottenuti con quelli delle procedure diagnostiche convenzionali (biochimiche, istopatologiche, etc) per ottenere una “firma” genetica individuale che consenta di sviluppare e/o implementare nuove misure per la diagnosi, l’inquadramento prognostico ed il trattamento personalizzato delle principali affezione neoplastiche umane (tumore della mammella, della prostata, del conlon-retto, del polmone). Tale approccio porterebbe alla produzione di supporti (biochips), distinti per popolazione e specifici per patologia, che dovrebbero quindi essere validati grazie al loro impiego su una serie di campioni biologici (biobanche di sangue periferico, tessuti) sia nontumorali che noplastici, ottenuti in studi clinici controllati e randomizzati già conclusi o in corso di svolgimento. I dati sono stati analizzati utilizzando modelli matematici e strumenti bioinformatici originali e innovativi che consentono di ottenere una capacità statistica ottimale col minor numero di dati possibile.
Durante il progetto è stata condotta un’analisi di espressione di miRNA differenzialmente espressi in campioni ematici e tissutali di soggetti sani ed affetti da carcinoma della mammella trattati con diverso trattamento alimentare. Sono stati evidenziati cluster specifici di miRNA differenzialmente espressi in sottoclassi di soggetti sia sani che affetti da patologia tumorale mammaria trattati con diverso trattamento alimentare, sono stati inoltre evidenziati targets specifici legati ai suddetti clusters di miRNA per i quali è stata effettuata un’analisi di enrichment funzionale, al fine di valutare le relazioni tra miRNA- targets-Pathways e sottoclassi di pazienti. Inoltre, dal punto di vista infrastrutturale, è stato progettato un database SQL per la memorizzazione e la fruizione dei dati dei pazienti coinvolti nello studio, con particolare attenzione ai dati grezzi di sequenziamento del trascrittoma, ai profili dei microRNA (miRNA), alle informazioni istologiche dei tessuti, ai miRNA differenzialmente espressi rispetto al controllo e ad eventuali biomarcatori legati a patologie.
